自学考试中，撰写毕业论文是应考者完成本科阶段学业的最后一个环节，也是对考生应用本专业知识和技能的一次综合性考查。
考生在通过资格审定后要在规定时间（通常一周左右）到主考院校办理交费手续。主考院校在收取相关费用后，将依据考生事先申报的选题方向，为考生指定指导教师，并告知考生指导教师的具体联系方式。同时发给考生撰写毕业论文的具体材料（包括撰写方式、论文要求、交稿时间、报到答辩时间、论文参选题目等）。
在与指导教师第一次见面后，考生将根据指导教师的要求，对已有的写作思路进行丰富或修正，并形成论文写作提纲。对于写作者来说，提纲质量的高低，直接关系到论文写作的成效。毫不夸张地说，写好了论文提纲，也就等于完成了论文写作任务的一半。
这里需要提醒考生的是，论文的正式写作应在提纲得到指导教师的认可后方可展开；论文从提纲到成稿，一般要经历多次反复。考生应虚心接受导师的指导，认真地对自己的论文进行修改和完善。
撰写毕业论文，首先是选择课题。选题是完成毕业论文撰写成败的关键。因为，选择题是完成毕业论文撰写的第一步，它实际上就是确定“写什么”的问题，亦即确定科学研究的方向。如果“写什么”不明确，“怎么写”就无从谈起。
自学考试办公室对毕业论文的选题有明确的要求：“为鼓励理论与工作实践结合，应考者可结合本单位或本人从事的工作提出论文题目，报主考学校审查同意后确立。也可由主考学校公布论文题目，由应考者选择。毕业论文的总体要求应与普通全日制高等学校相一致，做到通过论文写作和答辩考核，检验应考者综合运用专业知识的能力”。两种情况，都要坚持选择有科学价值和现实意义的课题和根据自己的能力选择切实可行的课题。
1.论文主体包含：序言+正文+结语：序言要写清写什么？为什么写？怎么写？结果是是什么？结语要写清论证的结果，做到首尾一贯。同时要写对该选题研究的展望，提及进一步探讨的问题或可能解决的途径等。
2.论点明确、清晰。必须有材料进行支撑。
3.论证必须根据论题的需要选择不同的论证结构形式，不同的论证结构形式，决定了本论部分的结构。
4.论证逻辑要严谨。合乎逻辑的论证，是最能说服别人的。
5.论证用的材料和论据，要真实且科学。
