自学考试是高等教育自学考试，函授是成人高考的学习方式。二者的区别在于概念不同，学习方式不同，文凭不同，考试次数不同，办学主体不同等。
概念不同
自考是个人自学、社会助学和国家考试相结合的高等教育形式，是我国社会主义高等教育体系的重要组成部分。是通过国家考试促进广泛的个人自学和社会助学活动，贯彻宪法鼓励自学成才的有关规定，造就和选拔德才兼备的专门人才，提高全民族的思想道德素质和科学文化素质，以适应社会主义现代化建设的需要。
函授是成人高等教育的一种学习形式，成人高等教育另外几种学习形式是业余学习(夜大)和脱产学习(全日制)。函授也是一种授课的方式。属于高等教育层次的一种学习层次，主要按各专业教学计划利用寒、暑假或国定假日派教师到各地函授站组织面授和考试。
考试次数不同
自考一年一般有两次次考试，考试时间安排在4、10月考试，个别省份会安排4次考试。
成人高考，考生需要通过全国统一的招生录取考试(成人高考)，达到所报院校的录取分数线后方可入学，一年一次录取考试，考试时间安排在10月份，录取的学生会在次年三月份正式入学，入学后由学校统一安排。
办学主体不同
各大学都有相应的成人教育学院或继续教育学院，所以成教的办学主体一般为国家，但目前也有一些成教是社会力量办学的。
自考的办学主体一般为个人或民间机构，也有一些是由各大学办的，但一般都是打着大学的旗号而已。
文凭不同
成考的文凭是各大学的成教学院发的，你考上了哪个大学的成教，毕业时就会盖有哪个大学的章。
自考的文凭上盖有两个章，一个是主考院校的章，另一个是当地自考委的章。
